Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lim2P56563 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lim2P56563 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms