Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms