Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PctpP53808 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PctpP53808 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PctpP53808 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms