Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lbx1P52955 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms