Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms