Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gli1P47806 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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