Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms