Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms