Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Timp3P39876 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms