Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms