Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms