Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms