Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms