Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnd3P30282 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms