Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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