Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxraP28700 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxraP28700 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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