Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa3P28310 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa3P28310 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms