Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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