Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PdgfraP26618 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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