Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CftrP26361 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CftrP26361 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CftrP26361 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CftrP26361 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CftrP26361 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms