Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms