Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RarbP22605 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RarbP22605 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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