Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3P21107 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3P21107 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3P21107 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3P21107 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3P21107 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3P21107 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3P21107 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms