Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms