Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VimP20152 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VimP20152 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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