Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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