Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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