Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms