Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms