Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms