Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms