Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RaraP11416 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RaraP11416 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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