Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prf1P10820 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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