Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms