Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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