Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms