Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms