Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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