Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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