Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dgcr6O35347 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dgcr6O35347 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dgcr6O35347 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dgcr6O35347 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dgcr6O35347 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Dgcr6O35347 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Dgcr6O35347 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dgcr6O35347 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms