Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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