Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ArxO35085 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ArxO35085 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ArxO35085 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ArxO35085 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ArxO35085 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms