Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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