Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap23O09044 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap23O09044 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap23O09044 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap23O09044 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms