Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp12O08736 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp12O08736 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.9 ms