Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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