Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp35M0QWN7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms