Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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