Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms