Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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